Gwella Ymchwil Oncoleg NLP
Cywirdeb Data Oncoleg: Trwyddedu, Dad-adnabod, ac Anodi ar gyfer Arloesedd Model NLP
Chwyldro Gofal Canser gyda Thechnolegau NLP Blaengar
Roedd angen datrysiad NLP datblygedig ar y cleient, sy'n chwaraewr mawr yn y diwydiant gofal iechyd, i brosesu swm sylweddol o gofnodion meddygol oncoleg. Fel rhan o fenter ganolog i fireinio ymchwil oncoleg, mae'r angen i gydbwyso dadansoddiad data manwl â safonau preifatrwydd llym yn hollbwysig. Mae'r astudiaeth achos hon yn amlinellu ein cyfraniadau at wella ymdrechion ymchwil y cleient trwy anodi data ffyddlon iawn, arferion dad-adnabod trwyadl, a chymhwyso technegau Prosesu Iaith Naturiol (NLP), i gyd o fewn y fframwaith rheoleiddio a ddarperir gan HIPAA.
Cyfrol
Heriau
Roedd y prosiect yn gofyn am ddealltwriaeth gynnil o ddogfennaeth glinigol, adnabyddiaeth fanwl o endidau meddygol, a'r gallu i gymhwyso labeli negyddu yn gywir, i gyd o fewn fframwaith diogel sy'n amddiffyn preifatrwydd cleifion yn unol â rheoliadau HIPAA. Roedd yr ymdrech yn gofyn nid yn unig am arbenigedd technegol wrth drin symiau mawr o ddata cymhleth ond hefyd agwedd strategol i ymgorffori adborth a chynnal ansawdd ar draws pob cam o'r broses anodi.
Disgrifiad Manwl o'r Gwasanaethau
| Categori | Disgrifiad |
| Cwmpas Data Clinigol Cynhwysfawr | Yn rhychwantu gwahanol fathau o nodiadau, lleoliadau gofal, ac is-arbenigeddau oncoleg, gan sicrhau set ddata gadarn sy'n adlewyrchu senarios clinigol amrywiol. |
| Dad-adnabod trwyadl | Sicrhau bod yr holl gofnodion sydd wedi'u labelu yn cael eu dad-adnabod yn unol â dull Safe Harbour HIPAA, gan sicrhau hyder cleientiaid mewn preifatrwydd a diogelwch data. |
| Canllawiau Anodi | Creu a gweithredu canllawiau anodi data safonol ar gyfer paratoi Cofnodion wedi'u Labelu yn unol â safonau HIPAA. |
| Strategaethau Anodi Uwch | Cynhaliwyd anodi â llaw o 10,000 o dudalennau o gofnodion yn ymwneud ag oncoleg gyda ffocws manwl ar nodi statws negyddu a gwybodaeth berthnasol arall yn unol â chanllawiau sefydledig. |
| Sicrwydd Ansawdd Trwyadl | Cyrraedd y safon ansawdd benodedig a amlinellir yn y canllaw |
Ateb
Roedd ein hymagwedd yn cynnwys y strategaethau allweddol canlynol:
Casglu Set Ddata Oncoleg wedi'i Addasu
O archif helaeth o dros 5 MN EHR, echdynnwyd is-set o ddata a ddewiswyd yn ofalus, gyda'r nod o fynd i'r afael â gofynion arbenigol y cleient ar gyfer data oncoleg gyda ffocws ar endidau genomig. Roedd y broses gasglu yn cynnwys creu rhestr gynhwysfawr o farcwyr tiwmor, genynnau, amrywiadau, a chamau TNM, gan ddefnyddio chwiliadau allweddair i nodi dogfennau sy'n doreithiog yn y data hwn. Defnyddiwyd mynegiadau rheolaidd i nodi ystod o amrywiadau genetig a chamau canser. Sicrhaodd y dull hwn, ynghyd â chwmpas data eang yn cwmpasu gwahanol fathau o ddogfennau, arbenigeddau, lleoliadau gofal, a data gan feddygon lluosog, set ddata oncoleg gynhwysfawr a pherthnasol.
Dad-adnabod trwyadl
Roedd y broses yn glynu'n gaeth at ddull Safe Harbour HIPAA ar gyfer dad-adnabod, sy'n gwarantu hyder y cleient mewn preifatrwydd a diogelwch data. Mae hyn yn golygu cael gwared ar yr holl Wybodaeth Iechyd Warchodedig (PHI) a gosod dalfannau wedi'u labelu yn ei lle, a thrwy hynny gynnal defnyddioldeb y data tra'n diogelu cyfrinachedd cleifion.
Newidynnau Dad-adnabod
| Categori | Is-gategori |
| Enw | Enw'r claf, enw'r meddyg, enw'r ymarferydd nyrsio, enw aelod o'r teulu, enw'r ganolfan feddygol, enw'r clinig, enw'r cartref nyrsio, Enw'r cwmni, enw'r Brifysgol |
| Oedran | |
| dyddiad | Patrwm dyddiad, patrwm Mis Blwyddyn, patrwm Diwrnod Mis, Patrwm Diwrnod Blwyddyn, Diwrnod, Mis, Blwyddyn, Tymor |
| Lleoliad | Gwlad, Talaith, Dinas, Stryd, Côd Post, Rhif yr ystafell, Rhif yr ystafell, Rhif y llawr |
| ID | Rhif nawdd cymdeithasol, Rhif cofnod meddygol, Rhif buddiolwr y cynllun iechyd, Rhif y Cyfrif, Rhif Tystysgrif/Trwydded, ID Biometrig, ID Cofnod, Rhif Derbyn, Rhif adnabod y cerbyd, Rhif plât trwydded Dynodwyr dyfais a rhif cyfresol |
| Cysylltu | Rhif ffôn, rhif ffacs, cyfeiriad e-bost, URL gwe, cyfeiriad IP |
enghraifft:
Ar 25 Medi, 2106, am 11:00 am, derbyniwyd Mr Harry Pace, 90 oed, i Ysbyty Cyffredinol Forrest i gael llawdriniaeth glun wedi'i threfnu, yr ymgynghorwyd ag ef yn flaenorol gan ei feddyg gofal sylfaenol Dr. Jose Martin, ac a fynychwyd gan Kendra Reith, MD. Yn ystod ei arhosiad, bu dan ofal Mary Hu, NP, a Suzan Ray, RN, ac ymgynghorwyd hefyd ag R. Charles Melancon, PA. Roedd ei lawdriniaeth, a gynhaliwyd ar yr un diwrnod â derbyniad, yn llwyddiannus ac ni adroddwyd am unrhyw gymhlethdodau. Yn dilyn llawdriniaeth, trosglwyddwyd Mr Pace i Ystafell 202, Llawr 2, i wella. Roedd ei wraig, Emma Pace, yn bresennol drwy'r amser a chafodd yr holl ddiweddariadau angenrheidiol. Yn ystod ei arhosiad byr, ymdriniwyd â'i gofnodion meddygol, gan gynnwys MRN MR99062619 a Chyfrif KV000014764, yn unol â phrotocolau safonol Cartref Nyrsio Gracewood, ei breswylfa flaenorol. Cafodd ei ryddhau yn ddiweddarach yr un diwrnod i ofal Clinig Cleifion Allanol Oakland ar gyfer gwellhad pellach. Drwy gydol y broses, roedd yr holl weithdrefnau'n cael eu dogfennu a'u diogelu gan gadw at safonau cyfrinachedd.
Enghraifft: Wedi'i ddad-nodi
On [Patrwm Dyddiad],am 11:00 y bore, Mr. [Enw'r Claf], oed [Oedran], derbyniwyd i [Enw'r Ganolfan Feddygol] ar gyfer llawdriniaeth glun wedi'i threfnu, yr ymgynghorwyd ag ef yn flaenorol gan ei feddyg gofal sylfaenol Dr. [Enw'r Meddyg], a mynychwyd gan [Enw'r Meddyg] MD. Yn ystod ei arosiad, bu dan ofal Mr [Ymarferydd Nyrsio], NP, a [Ymarferydd Nyrsio], RN, gyda [Enw'r Meddyg], PA, hefyd yn cael ei ymgynghori. Roedd ei lawdriniaeth, a gynhaliwyd ar yr un diwrnod â derbyniad, yn llwyddiannus ac ni adroddwyd am unrhyw gymhlethdodau. Yn dilyn llawdriniaeth, dywedodd Mr. [Enw Claf] ei drosglwyddo i Room no. [Rhif yr Ystafell], Llawr rhif. [Rhif y Llawr], am adferiad. Roedd ei wraig, [Enw Aelod o’r Teulu], yn bresennol drwy’r amser a chafodd yr holl ddiweddariadau angenrheidiol. Yn ystod ei arhosiad byr, ei gofnodion meddygol, gan gynnwys MRN [Rhif Cofnod Meddygol] a Chyfrif [Rhif cyfrif], eu trin yn unol â phrotocolau safonol o [Enw Cartref Nyrsio], ei breswylfa flaenorol. Rhyddhawyd ef yn ddiweddarach yr un diwrnod i ofal Mr [Enw clinig] am adferiad pellach. Drwy gydol y broses, roedd yr holl weithdrefnau'n cael eu dogfennu a'u diogelu gan gadw at safonau cyfrinachedd.
Canllawiau Anodi a Thechnegau Anodi Uwch
Roedd Shaip yn allweddol wrth sefydlu a gweithredu canllawiau anodi data safonol a sicrhaodd fod yr holl Gofnodion wedi'u Labelu yn cael eu paratoi'n gyson ac yn cydymffurfio â safonau HIPAA. At hynny, cafodd 10,000 o dudalennau o gofnodion meddygol amrywiol eu hanodi'n fanwl iawn, gan ganolbwyntio ar labelu manwl statws negyddu ac endidau eraill sy'n glinigol berthnasol gan gynnwys amrywiol is-arbenigeddau oncoleg. Cyflawnwyd yr anodiad gan dîm o anodyddion arbenigol gyda gwybodaeth arbenigol mewn oncoleg a rheoliadau preifatrwydd data.
Meini Prawf Anodi Cymhleth
| Categori | Is-gategori |
| Anodi Dyddiad (Oncoleg) | Dyddiad Diagnosis, Dyddiad Cam, Cychwyn, Dyddiad Gweithdrefn, Med Dyddiad Cychwyn, Med Dyddiad Gorffen, Dyddiad Cychwyn Ymbelydredd, Dyddiad Gorffen Ymbelydredd |
| Clefyd (Oncoleg) | Problem Canser, Histoleg, Statws Clinigol, Safle'r Corff, Ymddygiad, Graddfa, Cam Canser, Cam TNM, Prawf Marciwr Tiwmor, Dimensiynau, Cod |
| Triniaeth (Oncoleg) | Meddygaeth Canser, Dos Cyffuriau, Amlder, Llawfeddygaeth Canser, Canlyniad Llawdriniaeth, Dull Ymbelydredd, Dos Ymbelydredd |
| Genomeg | Cod Amrywio, Genynnau a Astudiwyd, Dull, Sbesimen |
| Negodi | Negyddol, Posibl Negyddol, Ansicr, Posibl Positif |
| NER clinigol | Problem canser - Safle'r Corff, Histoleg - Safle'r Corff, Ymddygiad - Safle'r Corff, Llawfeddygaeth Canser - Perthynas Safle'r Corff, Dull Ymbelydredd - Safle'r Corff, Histoleg - Gradd, Problem Canser - Dimensiwn |
enghraifft:
Datganiad Nodyn Clinigol Oncoleg
“Cafodd y claf Jane Doe ddiagnosis o ganser yr ysgyfaint lle nad yw’r celloedd yn fach (NSCLC), yn benodol adenocarsinoma, ar 03/05/2023. Mae'r canser wedi'i leoli yn llabed isaf dde'r ysgyfaint. Fe'i dosbarthir fel T3N2M0 yn ôl system lwyfannu TNM, gyda maint tiwmor o 5 cm x 3 cm. Nodwyd dileu exon EGFR 19 trwy ddadansoddiad PCR o sbesimen biopsi tiwmor. Cychwynnwyd cemotherapi gyda Carboplatin AUC 5 a Pemetrexed 500 mg/m² ar 03/20/2023 a bydd yn cael ei roi bob 3 wythnos. Dechreuodd therapi ymbelydredd pelydr allanol (EBRT) ar ddogn o 60 Gy mewn 30 ffracsiynau ar 04/01/2023. Mae triniaeth y claf yn barhaus, ac nid oes tystiolaeth o fetastasis yr ymennydd ar yr MRI diweddar. Nid yw'r posibilrwydd o ymlediad lymffofasgwlaidd wedi'i benderfynu eto, ac mae goddefgarwch y claf ar gyfer y regimen cemotherapi llawn yn parhau i fod yn ansicr.
Datganiad Nodyn Clinigol Oncoleg
Sicrwydd Ansawdd Trwyadl
Gweithredu fframwaith rheoli prosiect hyblyg a hwylusodd integreiddio adborth cleientiaid yn effeithiol tra'n cynnal safonau ansawdd llym. Gorfodwyd protocol sicrhau ansawdd cynhwysfawr, yn cyd-fynd â'r canllawiau i gyrraedd y meincnodau ansawdd gofynnol. Roedd y protocol hwn yn cynnwys rowndiau olynol o adolygu a dilysu, gan sicrhau cywirdeb a dibynadwyedd y data anodedig. Mae goruchwyliaeth fanwl o ansawdd mor fanwl yn hanfodol wrth lunio datrysiad NLP dibynadwy, sy'n hanfodol ar gyfer gwneud penderfyniadau clinigol gwybodus a rhagoriaeth ymchwil.
Canlyniad
Llwyddwyd i gyflawni 10,000 o Gofnodion Labeledig o ansawdd uchel, heb eu nodi, gan ddarparu set ddata ddiogel a gwerthfawr ar gyfer datblygiad model NLP y cleient. Arweiniodd cymhwyso NLP yn fanwl a chadw at safonau dad-adnabod HIPAA at set ddata hynod gywrain a fydd yn sail i ymdrechion ymchwil oncoleg parhaus y cleient ac yn y dyfodol, gan anelu yn y pen draw at wella canlyniadau cleifion oncoleg ac effeithlonrwydd darparu gofal.
Mae llwyddiant y prosiect yn dangos ein gallu i drin data meddygol cymhleth yn fanwl gywir, gan gyfrannu at nod y cleient o wella canlyniadau gofal cleifion a chyflymu arloesedd gofal iechyd.
Mae ein partneriaeth â Shaip wedi bod yn allweddol wrth hyrwyddo ein galluoedd NLP o fewn y parth oncoleg. Roedd ymdriniaeth broffesiynol â 10,000 o gofnodion meddygol, wedi'u hanodi â negyddu manwl ac endidau clinigol eraill, yn dangos eu hymrwymiad i ragoriaeth a chydymffurfiaeth. Ar ben hynny, mae eu hymrwymiad i safonau preifatrwydd fel HIPAA wedi rhoi adnoddau amhrisiadwy i ni i yrru ein mentrau AI o ddatblygu triniaethau oncolegol a diagnosteg arloesol ymlaen.
